DFGSP3-UE17-Substances Médicamenteuses de Synthèse et d'Origine Naturelle-TRAVAUX PRATIQUES

Etude conformationnelle et interactions [enzyme-inhibiteur] : applications à la protéase du VIH.

modélisation

Ce dernier chapitre concerne l'initiation à la modélisation moléculaire que l'étudiant recevra pendant les travaux pratiques.Cette initiation se fera sur des station de calcul "Silicon graphics".

La séance comprend deux parties : la première partie aborde d'abord un tutorial qui permet de construire l'atropine et de minimiser son énergie. Puis, la minimisation et l'analyse conformationnelle d'un dérivé de la coumarine sera étudiée. La seconde partie concerne les interactions [enzyme-inhibiteur] avec l'exemple de l'étude de complexes de la protéase du VIH. En détaillant le complexe [protéase-Urée], et en le comparant au complexe [protéase-coumarine], l'étudaint pourra conclure sur le potentiel de la coumarine en tant que nouvel inhibiteur de protéase.

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